Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt39Q6IFX4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Krt39Q6IFX4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Krt39Q6IFX4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Krt39Q6IFX4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Krt39Q6IFX4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Krt39Q6IFX4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Krt39Q6IFX4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Krt39Q6IFX4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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