Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
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PcolceQ61398 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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PcolceQ61398 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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PcolceQ61398 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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PcolceQ61398 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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PcolceQ61398 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms