Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NacadQ5SWP3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NacadQ5SWP3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms