Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shank3Q4ACU6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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