Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms