Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm5460Q3UQ97 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm5460Q3UQ97 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm5460Q3UQ97 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm5460Q3UQ97 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm5460Q3UQ97 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm5460Q3UQ97 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm5460Q3UQ97 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm5460Q3UQ97 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm5460Q3UQ97 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm5460Q3UQ97 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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