Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms