Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Parp8Q3UD82 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms