Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms