Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms