Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem52bQ0VBF2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms