Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms