Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
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Lrriq1Q0P5X1 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Lrriq1Q0P5X1 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrriq1Q0P5X1 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
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Lrriq1Q0P5X1 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
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Lrriq1Q0P5X1 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms