Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Kcnma1Q08460 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kcnma1Q08460 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Kcnma1Q08460 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Kcnma1Q08460 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Kcnma1Q08460 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Kcnma1Q08460 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Kcnma1Q08460 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms