Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms