Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cry1P97784 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cry1P97784 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms