Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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