Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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