Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms