Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms