Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Nub1P54729 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Nub1P54729 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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Nub1P54729 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nub1P54729 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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