Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Lbx1P52955 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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