Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rph3aP47708 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms