Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd4P46935 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms