Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms