Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms