Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtlP38585 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtlP38585 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TtlP38585 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TtlP38585 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TtlP38585 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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TtlP38585 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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TtlP38585 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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TtlP38585 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtlP38585 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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