Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddit3P35639 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms