Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vcam1P29533 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms