Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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