Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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