Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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