Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PparaP23204 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PparaP23204 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PparaP23204 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PparaP23204 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PparaP23204 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PparaP23204 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PparaP23204 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PparaP23204 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PparaP23204 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PparaP23204 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PparaP23204 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PparaP23204 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PparaP23204 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PparaP23204 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PparaP23204 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PparaP23204 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PparaP23204 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PparaP23204 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PparaP23204 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PparaP23204 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PparaP23204 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PparaP23204 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PparaP23204 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PparaP23204 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PparaP23204 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PparaP23204 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PparaP23204 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PparaP23204 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PparaP23204 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PparaP23204 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PparaP23204 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PparaP23204 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PparaP23204 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms