Protein–RNA interactions for Protein: P21761

Trhr, Thyrotropin-releasing hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhrP21761 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrhrP21761 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrhrP21761 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrhrP21761 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrhrP21761 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms