Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ifrd1P19182 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ifrd1P19182 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ifrd1P19182 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ifrd1P19182 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ifrd1P19182 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ifrd1P19182 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ifrd1P19182 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms