Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18525 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18525 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18525 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18525 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18525 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18525 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18525 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18525 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18525 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18525 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18525 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18525 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
P18525 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18525 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18525 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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