Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RhoP15409 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RhoP15409 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RhoP15409 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RhoP15409 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhoP15409 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhoP15409 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RhoP15409 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RhoP15409 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RhoP15409 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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