Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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DmdP11531 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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DmdP11531 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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DmdP11531 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DmdP11531 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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DmdP11531 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DmdP11531 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DmdP11531 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DmdP11531 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DmdP11531 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DmdP11531 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DmdP11531 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DmdP11531 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DmdP11531 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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DmdP11531 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DmdP11531 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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DmdP11531 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DmdP11531 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DmdP11531 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DmdP11531 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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DmdP11531 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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DmdP11531 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms