Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Myod1P10085 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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