Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms