Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtaP09225 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtaP09225 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtaP09225 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtaP09225 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtaP09225 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtaP09225 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtaP09225 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtaP09225 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtaP09225 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtaP09225 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtaP09225 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtaP09225 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtaP09225 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtaP09225 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtaP09225 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtaP09225 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtaP09225 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtaP09225 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LtaP09225 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms