Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa5P09021 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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