Protein–RNA interactions for Protein: O70401

Tspan6, Tetraspanin-6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan6O70401 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan6O70401 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tspan6O70401 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tspan6O70401 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan6O70401 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan6O70401 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tspan6O70401 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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