Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ArxO35085 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ArxO35085 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ArxO35085 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ArxO35085 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ArxO35085 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ArxO35085 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ArxO35085 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ArxO35085 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ArxO35085 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ArxO35085 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ArxO35085 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ArxO35085 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ArxO35085 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ArxO35085 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ArxO35085 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ArxO35085 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ArxO35085 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ArxO35085 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ArxO35085 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms