Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MttpO08601 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MttpO08601 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MttpO08601 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MttpO08601 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MttpO08601 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MttpO08601 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms