Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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