Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms