Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lipo1J3QME6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lipo1J3QME6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms