Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20828J3KMI7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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