Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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